Čišovský přestoupil do Plzně v létě 2011 z rumunského Temešváru, o dva roky později s týmem získal ligový titul. Dvakrát s ním postoupil do Champions League.
Slovenskému stoperovi kariéru předčasně ukončilo onemocnění nevyléčitelnou chorobou amyotrofickou laterální sklerózou (ALS). Svůj poslední ligový zápas odehrál v březnu 2014.
„Číslo 28 bude navždy patřit pouze Mariánu Čišovskému,“ řekl generální manažer klubu Adolf Šádek, když se klub rozhodl dres vyřadit. „Už nikdy se neobjeví na viktoriánském dresu.“
Dres Mariána Čišovského klub vyvěsil na čestné místo v sektoru za brankou, kde sídlí skalní fanoušci a od roku 2017 tam visí i dres Františka Rajtorala s číslem 27.
„Oba dva se nesmazatelně zapsali do klubové historie i do srdcí všech fanoušků. Věřím, že i naši příznivci ocení, že budou mít oba dresy po celou dobu na očích,“ podotkl Šádek.
V průběhu nedělního ligového utkání s Mladou Boleslaví plzeňští fanoušci uctí Čišovského památku symbolicky ve 28. minutě potleskem.